In Kolumbien existieren derzeit 56 Nationalparks oder Naturreservate, die größten davon im Amazonasgebiet. Ansonsten sind die zwischen acht Hektar und rund eine Million Hektar großen Areale im ganzen Land verteilt.

Kolumbien verfügt dabei über ein „Nationales System für geschützte Gebiete“ (Sistema Nacional de Áreas Protegidas / SINAP), über welches die Refugien ständig überwacht werden. Jedes ausgewiesene Schutzgebiet erhält dafür einen Management-Plan, welcher von der SINAP auf Grundlage eines im Jahr 2003 verabschiedeten Gesetzes administriert wird. Die zuständige Behörde hierfür ist dem kolumbianischen Umweltministerium untergliedert.

Die über SINAP verwalteten Gebiete werden dabei in vier Gruppen unterteilt:

• Schutzgebiete nationaler Ordnung: Hier werden neben den offiziellen Nationalparks auch zu schützende Wälder oder Wildtiere aufgeführt.
• Schutzgebiete regionaler Ordnung: 10 Gebiete wurden bereits markiert, zahlreiche weitere stehen auf der Warteliste.
• Schutzgebiete lokaler Ordnung: Bereits 20 Schutzgebiete ausgewiesen, weitere 100 Gemeinden warten auf entsprechende Eintragung.
• Schutzgebiete privater Ordnung: Teil im „Netzwerk der Naturreservate der Zivilgesellschaft“. Rund 160 Gebiete bislang registriert.

Der größte Park ist der „Parque Nacional Natural Serranía de Chiribiquete“ im Amazonasbecken. Er liegt in den Provinzen Caquetá und Guaviare und umfasst eine Fläche von 1.280.000 Hektar mit Wäldern, Savannengebieten und Bergen und bietet unberührten Lebensraum für zahllose Tiere und Pflanzen. Der kleinste Bereich ist die „Santuario de Flora Isla de La Corota“ in Nariño mit einer Fläche von nur 12 Hektar Land und 4 Hektar Wasser. Die Gesamtfläche aller Parks beträgt 12.602.320,7 Hektar (Stand 11/2011), dies sind mehr als 12 Prozent des Staatsgebietes.

Zwölf der 56 Schutzgebiete respektive Nationalparks liegen in der östlich gelegenen Amazonasregion des südamerikanischen Landes: